[Q-fitter's News] 활발한 국내외 학술활동[2017.08.31]

관리자
Sep/11/2017 05:45
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활발한 국내외 학술 활동


큐피터는 활발한 학술행사 참석 및 교육 개최 등을 통해 계량약리학의 학술적 저변 확대에 힘쓰고 있다. 모든 연구진은 2017 대한임상약리학회 춘계학술대회에 참석하여 학계 최신 동향을 파악하였으며, 자체적으로 PK Simulator Workshop 심화과정을 개최하여 연구진의 소프트웨어 사용 교육을 실시하였다.


큐피터의 학술 파트너인 PIPET(가톨릭계량약리학연구소)은 지난 6월 부다페스트에서 열린 2017 PAGE (Population Approach Group in Europe) meeting에서 “Translation of mAb PKPD: Theoretical Basis and Case Studies”라는 1-day 워크샵을 개최하였으며, 이어 프라하에서 열린 2017 EACPT (European Association for Clinical Pharmacology and Therapeutics) meeting에서 “Pharmacometrics in Academia - Clinical Researches and Dissemination to Industry”를 주제로 발표하였다. 또한, 7월에는 식품의약품안전평가원 초청으로 “합성의약품의 임상 초회용량 선정” 관련 강연을 진행하였다.


다가오는 학술행사로는 SCI-C가 주최하고, 큐피터와 PIPET이 공동 조직하는 SCI-C Pharmacometrics Course Basic-1 및 Intermediate-1 과정(서울 HJ convention, 8월 31일~9월 1일), 한중일 3국의 계량약리학 관련 단체의 공동 학술행사인 2017 Asian Pharmacometric Conference (일본 교토, 10월 24일 ~ 25일)가 있다. 특히, SCI-C Pharmacometrics Course는 참가 신청 개시 3일만에 정원 초과로 등록이 마감되어, 최근 크게 높아진 관계자들의 관심을 확인할 수 있었다. 2017 Asian Pharmacometric Conference에서는 4명의 큐피터 연자가 계량약리학의 최신 지견과 국내 계량약리학 서비스 경험을 발표할 예정이다.



<Q-fitter’s Scientific Updates - 계량약리학과 데이터과학>

계량약리학과 데이터과학(data science)은 매우 밀접한 관계이며, 최근 데이터과학 영역은 공유(share), 공개(open), 재현 가능한 연구(reproducible research)라는 주요한 화두를 가지고 급속도로 발전하고 있다. 이번 뉴스레터에서는 계량약리학과 데이터 과학이 접목된 영역의 최신 동향 몇 가지를 소개하고자 한다.



공개형 PBPK 및systems pharmacology 소프트웨어- Open systems pharmacology

(https://github.com/Open-Systems-Pharmacology)

기존의 Simcyp, Gastroplus, PK-Sim등 상용 PBPK 소프트웨어들은 편리한 사용자 환경과 방대한 데이터베이스를 기반으로 점차 사용자 수를 늘려가고 있으나, 높은 가격 정책으로 인해 국내 제약/바이오 회사들에서 이러한 소프트웨어의 실제 활용도는 매우 제한적인 상황이다. OSP는 2017년 5월부터 PBPK 모델링 소프트웨어인 PK-Sim과 systems pharmacology modeling에 좀 더 최적화된 Mobi를 오픈소스로 공개했다. 이와 함께, 사용자들과 양방향으로 소통 할 수 있는 'Forum', 소프트웨어 활용 교육 자료 등을 함께 제공하고 있어, 해당 소프트웨어에 누구든 쉽게 접근이 가능하다. 향후 PBPK 및 systems pharmacology에 대한 접근성과 활용도의 향상이 기대된다.



모델링 관련 지식 공유 플랫폼 - Model repository by DDMoRe

(http://repository.ddmore.eu/models)


DDMoRe (Drug Disease Model Resource)는 ' sharing knowledge to improve drug development'의 목적을 위해 컨소시엄 형태로서 신약 개발 효율화를 위한 모델링 관련 지식 공유 플랫폼을 구축하였다. 특히, 플랫폼의 내용 중 model repository에는 기존의 논문들에 사용된 실제 코드와 데이터셋(최종 모델을 이용한 시뮬레이션으로 생성함) 등이 공개되어 있어, 모델링을 학습하거나 개별 모델링을 진행하는 데에 실제적인 도움을 얻을 수 있다. 현재까지 111개 모델이 등록되어 있으며, 모델 업로드를 장려하기 위하여 대회를 진행하기도 한다. (https://www.ddmore.foundation/model-repository-challenge/)



모델링 학습 관련 공개 자료 - Open software & tutorial by Metrum Research Group

(https://www.metrumrg.com/courses/)


계량약리학 컨설팅 서비스 업체인 Metrum research group에서는 자체적으로 개발한 다양한 소프트웨어와 교육 자료를 2014년부터 무료화하여 일반에 공개하고 있다. 본 교육 자료는 주로 자사에서 개발한 공개형 소프트웨어에 대한 tutorial이지만, 각 소프트웨어와 관련된 계량약리학 이론 역시 부분적으로 함께 다루고 있다. 최근에는 NONMEM을 이용한 PK/PD모델링-시뮬레이션 절차의 효율화를 위한 R 패키지로서 'mrgsolve' (http://mrgsolve.github.io/)에 관한 내용이 중점적으로 개발되었으며, Bayesian modeling 소프트웨어 Stan을 이용한 PK/PD modeling 관련 강의자료(https://www.metrumrg.com/course/brief-introduction-bayesian-modeling-using-stan/) 역시 활발히 업로드되고 있다.